Электрофорез - метод разделения белковых молекул по их электрической подвижности в электрическом поле. Существует несколько видов электрофореза, таких как горизонтальный и вертикальный, а также иммуноблоттинг.

Хроматография - метод разделения белковых молекул на основе их взаимодействия с стационарной фазой. Существует несколько видов хроматографии, таких как гель-фильтрация, аффинная хроматография и ионообменная хроматография.

Ультрацентрифугирование - метод разделения белковых молекул на основе их размера и плотности при помощи высоких оборотов центрифуги.

Масс-спектрометрия - метод анализа белковых молекул на основе их массы и заряда. Позволяет определить массу белка, его структуру и посттрансляционные модификации.

Микроскопия - метод изучения размеров и формы белковых молекул при помощи светового или электронного микроскопа. Позволяет визуализировать белковые структуры на уровне отдельных молекул.