Механизм двойного замещения: В этом типе реакции фермент принимает на себя два субстрата и производит два продукта. Примером такой реакции может служить гидролиз пептидных связей белков ферментом пептидазой.

Последовательный упорядоченный механизм: В этом типе реакции сначала один субстрат связывается с ферментом, затем второй субстрат связывается с уже образовавшимся комплексом фермент-субстрат. Примером такой реакции может служить синтез аминокислот ферментами аминотрансферазами.

Неупорядоченный механизм: В этом типе реакции субстраты могут связываться с ферментом в любом порядке, и образуется несколько промежуточных комплексов фермент-субстрат. Примером такой реакции может служить синтез нуклеотидов ферментами рибонуклеотидредуктазами.