Производство пищевых продуктов: включает в себя производство йогуртов, сыров, кваса, пива, хлеба, солений и других продуктов с использованием микроорганизмов.

Производство антибиотиков и других медицинских препаратов: микробиологи занимаются разработкой и производством антибиотиков, вакцин, пробиотиков и других лекарственных препаратов.

Производство биотоплива: микроорганизмы используются для производства биодизеля, биоэтанола и других видов биотоплива.

Очистка сточных вод: микроорганизмы используются для биологической очистки сточных вод от загрязняющих веществ.

Производство биопластиков: микроорганизмы могут использоваться для производства биоразлагаемых пластиков.

Биотехнология в сельском хозяйстве: микроорганизмы используются для улучшения почвы, защиты растений от болезней и вредителей, а также для увеличения урожайности.

Производство косметических и бытовых продуктов: микроорганизмы могут использоваться для производства косметики, моющих средств, ароматизаторов и других бытовых продуктов.