Дефрагментация и оптимизация обычно происходят на диске, чтобы улучшить производительность и ускорить доступ к файлам. Однако также существуют программы и инструменты для оптимизации работы операционной системы в целом, такие как очистка реестра, управление запуском программ и службами, оптимизация работы процессов и т.д. Таким образом, оптимизация может проводиться как на уровне диска, так и на уровне системы в целом.